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来自远古的讯息(Telostmauscrits) (第1/2页)
冬日的暖yAn穿过研究室的窗户照到玛修背上,无视室外零下十二度低温的事实蒸着微微暖意。玛修左手食指轻敲上午刚刚送来的y碟外包装,右手食指蜷曲着用第二节指节撑着颧骨末端,右手拇指则g住他外扩的下颔。他盯着眼前的双萤幕,因为一再出现的一组数字微微皱起眉头。 y碟里的资料是他先前委托外包厂商,进行斑马鱼基因定序的成果。因为基因样本量很少,厂商会先将原本的DNA样本用酶切断、进行聚合酶链式反应PCR後才定出序列。因此玛修收到的资料是数万,甚至数百万串不等长、由代表不同硷基对的字母排列而成的字串。他必须将这些零碎的字串b对拼贴,最後现出序列原本的样貌。 不过这并不是让他皱眉的原因。定序的技术和重组字串的方法已经非常成熟了。像斑马鱼这种被研究透彻的模式动物,要出大纰漏并不容易。 让他感到担忧的事情是斑马鱼粒线TMitodrion的基因序列长度和线虫的一模一样。 当然不是指原始序列本身的长度一模一样。相较於细胞核的基因序列,粒线T的基因序列突变得更快,而且突变速率稳定,时常被用来评估生物的演化进程以及物种间的亲缘关系。线虫和斑马鱼两种生物天差地远,牠们粒线T的基因序列自然不同。 问题出在玛修手边的理论。他正在研究粒线T基因序列的突变与演化。如果粒线T的内共生假说──我们的真核生物祖先在二十亿年前收服了一种原核生物当「小弟」──是正确的,那麽现在所有生物的粒线T硷基排列应该都源自同一条序列。由此,玛修和他的导师正着手建构一种演算法,希望能直接从生物当前的粒线T基因序列推算始祖序列的型态,并依照两者之间的差异将各个生物安在演化树上的相对位置──实现生物演化树的大一统。 可是当玛修完成第一版演算法,并且尝试代入资料库中的已有的粒线T基因序列资料,他发现每种生物最後给出的始祖序列长度都一样──12,317±1对硷基。 不只线虫和斑马鱼,果蝇、文昌鱼和小鼠都一样。现在就连使用他们实验室自己培育的斑马鱼的基因序列进行分析,结果也还是完美的12,317对硷基。 完美的结果难道不完美吗? 当然不!玛修用的方法看来复杂华丽,可是脱不出成山的假设和它外cHa的本质。不同的物种应该要得出大致相同但细节迥异的结果。不停出现同一组数字,在同侪审查中只会被视为程式码出错的徵兆。 不过他已经花了三个月,一行一行、一字一字检查他的程式码不下数遍。他甚至邀请了国外另一间大学的研究团队依据他的理论进行研究,由文化背景迥异的研究员从头实现一次演算法,得出的结果还是一模一样。 那天晚上他又到了校园附近的酒吧买醉,不过身旁喧闹着的、无忧无虑的大学部学生让他愁上加愁。他趁着醉意打电话给前nV友诉苦。前nV友没有接,他就一直打、一直打…… 「都做到这样,你把文章送出去就是了。」 玛修想和前nV友复合的奋斗故事说到一半被无情打断。他沉浸在回忆里,愣了一会儿才发现Ai丽正在等待他的回应。 「什麽?」 「我说,你都做到这样了,」Ai丽把叉子尖端含进嘴里,用舌尖品嚐沙拉酱汁的酸甜味道,「不是应该先把文章送出去,看看期刊的审查委员有什麽意见再说吗?说不定他们根本不在意这种小事。」 玛修有点尴尬,他搔着後脑,说:「啊,现在想起来是这样没错。不过那时候总想着要把研究做得完美。毕竟那篇文章送出去,大概整个生物资讯学都会被翻过来吧?」 玛修用轻松的语调讲着一般研究人员一辈子都不敢奢望的经历。不过卡琳对於玛修的藉口并不买单,她靠到Ai丽身边悄声说道:「他只是想打给他前nV友。」 「所以呢?」Ai丽完全不遮掩,单刀直入地问玛修:「你前nV友有接电话吗?」
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